هيأت امناء
جهاددانشگاهي‌مطابق اساسنامه مصوب جلسات 262 و 263 شوراي عالي انقلاب فرهنگي "نهادي است عمومي و غيردولتي زير نظر شوراي عالي انقلاب فرهنگي، داراي شخصيت مستقل" با اهداف" گسترش تحقيقات و شكوفايي روحيه تتبع استعدادها،درسطح جامعه براي نيل به خود اتكايي ، توسعه امور فرهنگي، گسترش طرحهاي كاربردي و نيمه صنعتي" با وظايفي كه در ماده سوم اساسنامه به عهده آن گذاشته شده است فعاليت دارد.
در اساسنامه براي اين نهاد سه ركن در نظر گرفته شده است.
- عالي‌ترين مرجع سياستگزاري (هيأت امناء(
- بالاترين مقام اجرايي (رئيس جهادانشگاهي
- تعيين كننده خط مشي و ناظر بر فعاليتها (شوراي علمي(
هيأت امناء جهاددانشگاهي براساس ماده چهارم و پنجم اساسنامه مصوب شوراي عالي انقلاب فرهنگي به عنوان يكي از اركان جهاددانشگاهي به عنوان ،" عالي‌ترين مرجع سياستگزاري" اين نهاد شناخته مي‌شود.
در جهت اجراي وظايف كلي جهاد و اجراي سياست‌هاي تبيين شده توسط هيأت امناء و جهت فراهم آوردن زمينه فعاليتهاي علمي و پژوهشي، اجراي دوره‌هاي رسمي و آموزش‌هاي علمي كاربردي و تبليغ و ترويج فرهنگ و هنر اسلامي و برنامه‌ريزي فرهنگي و تربيتي، چهار حوزه معاونت پژوهش و فناوري، آموزشي، فرهنگي، پشتيباني و امور مجلس در ستاد مركزي جهاد كه "دفترمركزي جهاددانشگاهي" ناميده مي‌شود تشكيل شده است.
اعضاء هيأت امنا
در حال حاضر هیات امنا جهاددانشگاهی از افراد زیر تشکیل شده است:
دکتر حمیدرضا طیبی (رییس جهاد دانشگاهی و رییس هیات امنا)
حجت السلام و المسلمین محمد محمدیان- رییس نمایندگی نهاد رهبری در دانشگاه ها
دکتر محمدباقر نوبخت -معاون رییس جمهور و رییس سازمان مدیریت برنامه ریزی کشور
دکتر محمد فرهادي - وزیر علوم تحقیقات و فناوری
دکتر سید حسن قاضی زاده هاشمی -وزیربهداشت ،درمان و آموزش پزشکی
دکتر محمدرضا مخبر دزفولی- دبیر شورای عالی انفلاب فرهنگی
دکتر عبدالحسین شاهوردی - عضو هیات علمی و سرپرست پژوهشگاه رویان جهاددانشگاهی
دکتر محسن قرنفلی- عضو هیات علمی و مشاور رییس جهاددانشگاهی
دکتر محمد حسین ایمانی خوشخو- عضو هیات علمی و سرپرست پارك علوم و فناوري‌هاي نرم و صنايع فرهنگي جهاددانشگاهی
دکتر محمدرضا پورعابدی – دبیر هیات امنا و معاون پژوهش و فناوری جهاددانشگاهی